首先要清楚各个检查机构的职责，搞清海关、航空公司各自的职责，在不同环节出示相应护照，搭配使用。
- 使用哪本护照订机票
如果要去B国护照的任一免签国，出发时应用B国护照定机票。
航空公司的职责是：确认你是否有资格去目的国（有签证、免签护照、还是当地公民） - 使用哪本护照办登机牌Check in
到达机场航空公司柜台check in取登机牌时，出示B国护照。与第1步护照一致，航空出票柜台是不会在意你为何能呆在本国的，同时他们的信息与出境海关处是隔离的 。check-in的打印机票工作人员，最关心的是你能不能合法进入目的国，其他不是他关心的范围。如果你在预定时用的护照需要签证才能进入目的国，没关系，你可以大方给他另一本无需签证的护照，他会帮助你完成出票程序。航空出票柜台的职责是：核对护照信息是否与机票个人信息一致，再次确认你是否有资格去目的国，若信息不一致，航空公司是不敢出票的，否则会面临巨额罚款。把乘机人信息传给入境国海关处，告诉他们有一个B国籍的人要来啦。 - 出境海关检查，出示哪本护照
出境时，应向海关出示你合法呆在本国的A国护照。出境海关职责是：确保你之前是否有资格待在本国，比如你从A国出境，就出示A国护照，证明之前合法呆在A国。出境海关是不会看出行机票的，他们不关心你去哪（亚洲部分国家例外）。如海关询问，非要看出行机票，用B国护照购买的机票上名字和A国护照上名字一致，那么也能顺利过关。万一机器查验发现机票所属国籍和出示的A国护照不一致，那就诚实说明两本护照即可，他们只是要了解真实情况，双国籍不属于他们监管的职责范围。（美英加等国出境不检查）当你在进入离境检查之前，这句话永远不要忘记:”用什么护照来的，用什么护照离开。”比如，你进入这个国家时，使用的是澳大利亚护照，那么离境时，也应该使用澳大利亚护照，一进一出，正负相抵。 - 登机前检查，应出示什么护照登机前检查，应出示B国护照和机票 登机检察人员的职责是：核对登机口是否正确，最后确认护照信息是否与机票一致。这一环节有时候完全省略，有时候只看机票，具体情况以当地机场为主，但出入不大。
- 入境国海关检查，用哪本护照？
入境目的国海关，出示B国护照。
入境海关职责是： 确保是否有资格入境，拿本能免签的B国护照，当然有资格入境；核对信息，检查是否与航空公司发来的一致；入境海关是不会关注你从哪里来的。亚洲部分国家例外，如果海关询问，那就合理诚实说明。一样的道理，他们只是要了解你是否合法入境，双国籍不属于他们监管的职责范围。到达目的国之后，你应该选择在此国家对你最有利的护照，呈递给边检查验询问。
大陆和澳门已经在某些口岸共享出入境信息，过境旅客只需要检查一次旅行证件，两边政府可以同时查验。所以不建议两本护照持有者在澳门护照替换。
泰国，马来西亚之类，旅游立国的国家，这些国家其实和发达国家的处理方式一致，无须太多担心。例如，你身在中国，准备去泰国旅游，在中国时，预订来回机票，check-in，出中国边检，全用中国护照，但是到了泰国以后，用加拿大护照入境，完全没有问题。离开泰国时，切记，check-in用中国护照，因为你用加拿大护照也没法进入中国（需要签证），离境检查用加拿大护照，进入中国边检（含自助入关）用中国护照。这样操作，可以完全省去泰国的签证费或者节省在泰国的通关时间。
老挝，越南之类的国家，这些国家的边检涉及到索取小费之类的行为，在这些国家，如果两本护照真的给你带来了一些通关困扰，应该也是没有钱解决不了的事。虽然中国不承认双国籍，但是大多数办理外国护照项目的投资人还是因为各种原因希望保留中国国籍，为了做到这一点，大家不在中国过境使用外国护照，默默保持双重国籍。
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